Гръцкото животновъдство се намира под строго наблюдение от Европейската комисия, която е дала срок на страната до февруари 2009 да подобри конторла в животновъдните ферми. В противен случай комисията ще забрани движението на гръцки продукти от животински произход както в рамките на Съюза, така и в трети страни. Причината е в несъществуващия ветеринарно-санитарен контрол във фермите, където не се взимат проби от животните за наличието на тежки метали и други опасни за човешкото здраве вещества, няма достатъчно лаборатории за извършването на подобни изследвания и няма достатъчно квалифициран ветеринарно-медицински персонал.

                Експертите на Европейския съюз проверяваха цяла седмица гръцкото животновъдство и го класираха на... 28-мо място сред 27-те членки на организацията! Те обявиха 9 следващи проверки, които ще се извършват всеки месец и ще обхванат всички етапи от производството на храни от животински произход -  хранителна промишленост, контрол на заболяванията, които се предават от животните на хората, хигиена на кланниците, лаборатории за тежки метали и отрови в месото, фураж за животните, лекарства и антибиотици, кадрова политика, митнически контрол. Първата проверка е насрочена за 9 януари 2009 година.

Европейската комисия нееднократно е установявала празноти в системата на животновъдството на Гърция и нееднократно е отправяла предупреждения към страната. Подобна проверка бе направена и през юли, когато европейските експерти откриха, че в Гърция се правят само една четвърт от ветеринарните изследвания, които предвижда европейското законодателство в тази област. Едно от изследванията, което не се прави редовно е за наличието на бруцелоза сред овцете. Комисията е дала срок на Гърция до 31 декември 2008 година да започне да провежда редовно тези изследвания, в противен случай ще забрани обработката на мляко от неизследвани животни в млекопреработвателните комбинати на страната.  Мярката ще има изключително неблагоприятни последици за производството на различни видове сирена и млечни продукти в Гърция.